Během období odstávky a skladování by sušicí zařízení mělo být umístěno na suchém, dobře větraném místě, aby se zabránilo dlouhodobému vystavení vlhkému, vysokoteplotnímu nebo otevřenému prostředí. To je zvláště důležité pro zařízení na sušení obilí, která obvykle obsahují vnitřní součásti, jako jsou ventilátory, motory, dopravní mechanismy a elektrické řídicí systémy; špatné skladovací podmínky mohou snadno vést k problémům, jako je degradace kabeláže, koroze kovů a poškození součástí vlhkostí. Před přemístěním do skladu musí zařízení projít důkladným vnitřním čištěním, aby se odstranily zbytky zrna, prachu nebo úlomků, čímž se zabrání růstu plísní nebo zamoření škůdci způsobenými dlouhodobým hromaděním. Současně by měly být komplexně zkontrolovány sušicí zásobníky, horkovzdušná potrubí a dopravní komponenty; jakékoli opotřebované nebo uvolněné díly musí být okamžitě opraveny nebo utaženy, aby se předešlo poruchám během budoucího provozu.
Během doby skladování musí být také provedena vhodná ochranná opatření pro kritické komponenty. Odkryté kovové povrchy na zařízení by měly být natřeny antikorozním olejem, zatímco ložiska, řetězy a převodové mechanismy vyžadují pravidelné mazání a údržbu, aby se zabránilo zadření nebo rezivění způsobenému delší nečinností. Elektrické komponenty, jako jsou motory, ovládací skříně a senzory, by měly být v ideálním případě pokryty materiály odolnými proti vlhkosti nebo utěsněny samostatně, aby se zabránilo vnikání vlhkosti na úkor výkonu zařízení. Pokud má zařízení zůstat delší dobu v nečinnosti, kolové nebo mobilní sušicí stroje by měly být řádně podepřeny, aby se uvolnil tlak na pneumatiky a zabránilo se deformaci způsobené delším zatížením. Kromě toho musí skladovací zařízení dodržovat přísné normy požární bezpečnosti; stohování hořlavých nebo výbušných materiálů kolem zařízení je přísně zakázáno, aby byla zajištěna bezpečnost skladování. Dodržování standardizovaných postupů správy skladování nejen prodlužuje životnost sušicích strojů, ale také snižuje budoucí náklady na údržbu a zároveň zvyšuje celkovou stabilitu a bezpečnost provozu zařízení.

